KDM3B

KDM3B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C8D
Ідентифікатори
Символи	KDM3B, 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, NET22, lysine demethylase 3B, DIJOS
Зовнішні ІД	OMIM: 609373 MGI: 1923356 HomoloGene: 41145 GeneCards: KDM3B
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • antioxidant activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone demethylase activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • chromatin DNA binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity Клітинна компонента • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • cellular oxidant detoxification • response to cisplatin • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 demethylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51780	277250
Ensembl	ENSG00000120733	ENSMUSG00000038773
UniProt	Q7LBC6	Q6ZPY7
RefSeq (мРНК)	NM_016604	NM_001081256 NM_029518
RefSeq (білок)	NP_057688	NP_001074725
Локус (UCSC)	Хр. 5: 138.35 – 138.44 Mb	Хр. 18: 34.91 – 34.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KDM3B (англ. Lysine demethylase 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 761 амінокислот, а молекулярна маса — 191 581.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADAAASPVG		KRLLLLFADT		AASASASAPA		AAAASGDPGP		ALRTRAWRAG
TVRAMSGAVP		QDLAIFVEFD		GCNWKQHSWV		KVHAEEVIVL		LLEGSLVWAP
REDPVLLQGI		RVSIAQWPAL		TFTPLVDKLG		LGSVVPVEYL		LDRELRFLSD
ANGLHLFQMG		TDSQNQILLE		HAALRETVNA		LISDQKLQEI		FSRGPYSVQG
HRVKIYQPEG		EEGWLYGVVS		HQDSITRLME		VSVTESGEIK		SVDPRLIHVM
LMDNSAPQSE		GGTLKAVKSS		KGKKKRESIE		GKDGRRRKSA		SDSGCDPASK
KLKGDRGEVD		SNGSDGGEAS		RGPWKGGNAS		GEPGLDQRAK		QPPSTFVPQI
NRNIRFATYT		KENGRTLVVQ		DEPVGGDTPA		SFTPYSTATG		QTPLAPEVGG
AENKEAGKTL		EQVGQGIVAS		AAVVTTASST		PNTVRISDTG		LAAGTVPEKQ
KGSRSQASGE		NSRNSILASS		GFGAPLPSSS		QPLTFGSGRS		QSNGVLATEN
KPLGFSFGCS		SAQEAQKDTD		LSKNLFFQCM		SQTLPTSNYF		TTVSESLADD
SSSRDSFKQS		LESLSSGLCK		GRSVLGTDTK		PGSKAGSSVD		RKVPAESMPT
LTPAFPRSLL		NARTPENHEN		LFLQPPKLSR		EEPSNPFLAF		VEKVEHSPFS
SFASQASGSS		SSATTVTSKV		APSWPESHSS		ADSASLAKKK		PLFITTDSSK
LVSGVLGSAL		TSGGPSLSAM		GNGRSSSPTS		SLTQPIEMPT		LSSSPTEERP
TVGPGQQDNP		LLKTFSNVFG		RHSGGFLSSP		ADFSQENKAP		FEAVKRFSLD
ERSLACRQDS		DSSTNSDLSD		LSDSEEQLQA		KTGLKGIPEH		LMGKLGPNGE
RSAELLLGKS		KGKQAPKGRP		RTAPLKVGQS		VLKDVSKVKK		LKQSGEPFLQ
DGSCINVAPH		LHKCRECRLE		RYRKFKEQEQ		DDSTVACRFF		HFRRLIFTRK
GVLRVEGFLS		PQQSDPDAMN		LWIPSSSLAE		GIDLETSKYI		LANVGDQFCQ
LVMSEKEAMM		MVEPHQKVAW		KRAVRGVREM		CDVCETTLFN		IHWVCRKCGF
GVCLDCYRLR		KSRPRSETEE		MGDEEVFSWL		KCAKGQSHEP		ENLMPTQIIP
GTALYNIGDM		VHAARGKWGI		KANCPCISRQ		NKSVLRPAVT		NGMSQLPSIN
PSASSGNETT		FSGGGGPAPV		TTPEPDHVPK		ADSTDIRSEE		PLKTDSSASN
SNSELKAIRP		PCPDTAPPSS		ALHWLADLAT		QKAKEETKEA		GSLRSVLNKE
SHSPFGLDSF		NSTAKVSPLT		PKLFNSLLLG		PTASNNKTEG		SSLRDLLHSG
PGKLPQTPLD		TGIPFPPVFS		TSSAGVKSKA		SLPNFLDHII		ASVVENKKTS
DASKRACNLT		DTQKEVKEMV		MGLNVLDPHT		SHSWLCDGRL		LCLHDPSNKN
NWKIFRECWK		QGQPVLVSGV		HKKLKSELWK		PEAFSQEFGD		QDVDLVNCRN
CAIISDVKVR		DFWDGFEIIC		KRLRSEDGQP		MVLKLKDWPP		GEDFRDMMPT
RFEDLMENLP		LPEYTKRDGR		LNLASRLPSY		FVRPDLGPKM		YNAYGLITAE
DRRVGTTNLH		LDVSDAVNVM		VYVGIPIGEG		AHDEEVLKTI		DEGDADEVTK
QRIHDGKEKP		GALWHIYAAK		DAEKIRELLR		KVGEEQGQEN		PPDHDPIHDQ
SWYLDQTLRK		RLYEEYGVQG		WAIVQFLGDA		VFIPAGAPHQ		VHNLYSCIKV
AEDFVSPEHV		KHCFRLTQEF		RHLSNTHTNH		EDKLQVKNII		YHAVKDAVGT
LKAHESKLAR		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5