Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
EMX2
Ідентифікатори
Символи
EMX2 , empty spiracles homeobox 2
Зовнішні ІД
OMIM : 600035 MGI: 95388 HomoloGene: 3023 GeneCards: EMX2
Пов'язані генетичні захворювання
schizencephaly [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• cerebral cortex development • multicellular organism development • регуляція експресії генів • renal system development • forebrain development • brain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell proliferation in forebrain • forebrain cell migration • cerebral cortex regionalization • neuron differentiation • anterior/posterior pattern specification • dentate gyrus development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ureter morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
н/д
Хр. 19: 59.45 – 59.45 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
EMX2 (англ. Empty spiracles homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 252 амінокислот , а молекулярна маса — 28 303[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MFQPAPKRCF TIESLVAKDS PLPASRSEDP IRPAALSYAN SSPINPFLNG
FHSAAAAAAG RGVYSNPDLV FAEAVSHPPN PAVPVHPVPP PHALAAHPLP
SSHSPHPLFA SQQRDPSTFY PWLIHRYRYL GHRFQGNDTS PESFLLHNAL
ARKPKRIRTA FSPSQLLRLE HAFEKNHYVV GAERKQLAHS LSLTETQVKV
WFQNRRTKFK RQKLEEEGSD SQQKKKGTHH INRWRIATKQ ASPEEIDVTS
DD
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Noonan F.C., Mutch D.G., Mallon M., Goodfellow P.J. (2001). Characterization of the homeodomain gene EMX2: sequence conservation, expression analysis and a search for mutations in endometrial cancers. Genomics . 76 : 37—44. PMID 11549315 DOI :10.1006/geno.2001.6590
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші