TAF4

TAF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H3O, 2P6V
Ідентифікатори
Символи	TAF4, TAF2C, TAF2C1, TAF4A, TAFII130, TAFII135, TATA-box binding protein associated factor 4, TAFII-135, TAFII-130, TAF(II)135, TAF(II)130
Зовнішні ІД	OMIM: 601796 MGI: 2152346 HomoloGene: 55723 GeneCards: TAF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • aryl hydrocarbon receptor binding • transcription factor binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • transcription factor TFTC complex • transcription factor TFIID complex • нуклеоплазма • MLL1 complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • ovarian follicle development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0022415 viral process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6874	228980
Ensembl	ENSG00000130699	ENSMUSG00000039117
UniProt	O00268	E9QAP7
RefSeq (мРНК)	NM_003185	NM_001081092
RefSeq (білок)	NP_003176	NP_001074561
Локус (UCSC)	Хр. 20: 61.95 – 62.07 Mb	Хр. 2: 179.55 – 179.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF4 (англ. TATA-box binding protein associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 085 амінокислот, а молекулярна маса — 110 114.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGSDLLDE		VFFNSEVDEK		VVSDLVGSLE		SQLAASAAHH		HHLAPRTPEV
RAAAAGALGN		HVVSGSPAGA		AGAGPAAPAE		GAPGAAPEPP		PAGRARPGGG
GPQRPGPPSP		RRPLVPAGPA		PPAAKLRPPP		EGSAGSCAPV		PAAAAVAAGP
EPAPAGPAKP		AGPAALAARA		GPGPGPGPGP		GPGPGPGKPA		GPGAAQTLNG
SAALLNSHHA		AAPAVSLVNN		GPAALLPLPK		PAAPGTVIQT		PPFVGAAAPP
APAAPSPPAA		PAPAAPAAAP		PPPPPAPATL		ARPPGHPAGP		PTAAPAVPPP
AAAQNGGSAG		AAPAPAPAAG		GPAGVSGQPG		PGAAAAAPAP		GVKAESPKRV
VQAAPPAAQT		LAASGPASTA		ASMVIGPTMQ		GALPSPAAVP		PPAPGTPTGL
PKGAAGAVTQ		SLSRTPTATT		SGIRATLTPT		VLAPRLPQPP		QNPTNIQNFQ
LPPGMVLVRS		ENGQLLMIPQ		QALAQMQAQA		HAQPQTTMAP		RPATPTSAPP
VQISTVQAPG		TPIIARQVTP		TTIIKQVSQA		QTTVQPSATL		QRSPGVQPQL
VLGGAAQTAS		LGTATAVQTG		TPQRTVPGAT		TTSSAATETM		ENVKKCKNFL
STLIKLASSG		KQSTETAANV		KELVQNLLDG		KIEAEDFTSR		LYRELNSSPQ
PYLVPFLKRS		LPALRQLTPD		SAAFIQQSQQ		QPPPPTSQAT		TALTAVVLSS
SVQRTAGKTA		ATVTSALQPP		VLSLTQPTQV		GVGKQGQPTP		LVIQQPPKPG
ALIRPPQVTL		TQTPMVALRQ		PHNRIMLTTP		QQIQLNPLQP		VPVVKPAVLP
GTKALSAVSA		QAAAAQKNKL		KEPGGGSFRD		DDDINDVASM		AGVNLSEESA
RILATNSELV		GTLTRSCKDE		TFLLQAPLQR		RILEIGKKHG		ITELHPDVVS
YVSHATQQRL		QNLVEKISET		AQQKNFSYKD		DDRYEQASDV		RAQLKFFEQL
DQIEKQRKDE		QEREILMRAA		KSRSRQEDPE		QLRLKQKAKE		MQQQELAQMR
QRDANLTALA		AIGPRKKRKV		DCPGPGSGAE		GSGPGSVVPG		SSGVGTPRQF
TRQRITRVNL		RDLIFCLENE		RETSHSLLLY		KAFLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• Mengus G., May M., Carre L., Chambon P., Davidson I. (1997). Human TAF(II)135 potentiates transcriptional activation by the AF-2s of the retinoic acid, vitamin D3, and thyroid hormone receptors in mammalian cells. Genes Dev. 11: 1381—1395. PMID 9192867 DOI:10.1101/gad.11.11.1381
• Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., Chen J.-L., Admon A. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFII130 and hTAFII100. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13611—13616. PMID 8942982 DOI:10.1073/pnas.93.24.13611
• Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 DOI:10.1101/gad.10.11.1369
• Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 DOI:10.1074/jbc.274.26.18285
• Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030

Див. також

• Хромосома 20