Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ETV3
Ідентифікатори
Символи
ETV3 , METS, PE-1, PE1, bA110J1.4, ETS variant 3, ETS variant transcription factor 3
Зовнішні ІД
OMIM : 164873 MGI: 1350926 HomoloGene: 21085 GeneCards: ETV3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DEAD/H-box RNA helicase binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• RNA polymerase II transcription repressor complex • transcription repressor complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 157.12 – 157.14 Mb
Хр. 3: 87.43 – 87.45 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ETV3 (англ. ETS variant 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот , а молекулярна маса — 57 001[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKAGCSIVEK PEGGGGYQFP DWAYKTESSP GSRQIQLWHF ILELLQKEEF
RHVIAWQQGE YGEFVIKDPD EVARLWGRRK CKPQMNYDKL SRALRYYYNK
RILHKTKGKR FTYKFNFNKL VMPNYPFINI RSSGVVPQSA PPVPTASSRF
HFPPLDTHSP TNDVQPGRFS ASSLTASGQE SSNGTDRKTE LSELEDGSAA
DWRRGVDPVS SRNAIGGGGI GHQKRKPDIM LPLFARPGMY PDPHSPFAVS
PIPGRGGVLN VPISPALSLT PTIFSYSPSP GLSPFTSSSC FSFNPEEMKH
YLHSQACSVF NYHLSPRTFP RYPGLMVPPL QCQMHPEEST QFSIKLQPPP
VGRKNRERVE SSEESAPVTT PTMASIPPRI KVEPASEKDP ESLRQSAREK
EEHTQEEGTV PSRTIEEEKG TIFARPAAPP IWPSVPISTP SGEPLEVTED
SEDRPGKEPS APEKKEDALM PPKLRLKRRW NDDPEARELS KSGKFLWNGS
GPQGLATAAA DA
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Klemsz M., Hromas R., Raskind W., Bruno E., Hoffman R. (1994). PE-1, a novel ETS oncogene family member, localizes to chromosome 1q21-q23. Genomics . 20 : 291—294. PMID 8020980 doi :10.1006/geno.1994.1169
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 doi :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші