HOXA9

HOXA9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PUF
Ідентифікатори
Символи	HOXA9, ABD-B, HOX1, HOX1.7, HOX1G, homeobox A9
Зовнішні ІД	OMIM: 142956 MGI: 96180 HomoloGene: 7766 GeneCards: HOXA9
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex • цитоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • endothelial cell activation • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of myeloid cell differentiation • Сперматогенез • single fertilization • male gonad development • anterior/posterior pattern specification • proximal/distal pattern formation • регуляція експресії генів • mammary gland development • embryonic forelimb morphogenesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system development • uterus development • definitive hemopoiesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3205	15405
Ensembl	ENSG00000078399	ENSMUSG00000038227
UniProt	P31269	P09631
RefSeq (мРНК)	NM_152739 NM_002142	NM_001277238 NM_010456
RefSeq (білок)	NP_689952	NP_001264167 NP_034586
Локус (UCSC)	Хр. 7: 27.16 – 27.18 Mb	Хр. 6: 52.2 – 52.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXA9 (англ. Homeobox A9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 30 172.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATTGALGNY		YVDSFLLGAD		AADELSVGRY		APGTLGQPPR		QAATLAEHPD
FSPCSFQSKA		TVFGASWNPV		HAAGANAVPA		AVYHHHHHHP		YVHPQAPVAA
AAPDGRYMRS		WLEPTPGALS		FAGLPSSRPY		GIKPEPLSAR		RGDCPTLDTH
TLSLTDYACG		SPPVDREKQP		SEGAFSENNA		ENESGGDKPP		IDPNNPAANW
LHARSTRKKR		CPYTKHQTLE		LEKEFLFNMY		LTRDRRYEVA		RLLNLTERQV
KIWFQNRRMK		MKKINKDRAK		DE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Patel C.V., Sharangpani R., Bandyopadhyay S., DiCorleto P.E. (1999). Endothelial cells express a novel, tumor necrosis factor-alpha-regulated variant of HOXA9. J. Biol. Chem. 274: 1415—1422. PMID 9880515 DOI:10.1074/jbc.274.3.1415
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7