NKX2-2

NKX2-2
Ідентифікатори
Символи	NKX2-2, NKX2.2, NKX2B, NK2 homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604612 MGI: 97347 HomoloGene: 1879 GeneCards: NKX2-2
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • pancreatic PP cell fate commitment • GO:1904578 response to organic cyclic compound • розвиток клітин • spinal cord oligodendrocyte cell fate specification • response to progesterone • neuron fate specification • response to glucose • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • brain development • astrocyte differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell differentiation • регуляція диференціювання клітин • smoothened signaling pathway • oligodendrocyte development • spinal cord motor neuron differentiation • digestive tract development • pancreatic A cell fate commitment • type B pancreatic cell fate commitment • ventral spinal cord interneuron fate determination • type B pancreatic cell development • spinal cord oligodendrocyte cell differentiation • optic nerve development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • endocrine pancreas development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4821	18088
Ensembl	ENSG00000125820	ENSMUSG00000027434
UniProt	O95096	P42586
RefSeq (мРНК)	NM_002509	NM_001077632 NM_010919
RefSeq (білок)	NP_002500	NP_001071100 NP_035049
Локус (UCSC)	Хр. 20: 21.51 – 21.51 Mb	Хр. 2: 147.18 – 147.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NKX2-2 (англ. NK2 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 133.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLTNTKTGF		SVKDILDLPD		TNDEEGSVAE		GPEEENEGPE		PAKRAGPLGQ
GALDAVQSLP		LKNPFYDSSD		NPYTRWLAST		EGLQYSLHGL		AAGAPPQDSS
SKSPEPSADE		SPDNDKETPG		GGGDAGKKRK		RRVLFSKAQT		YELERRFRQQ
RYLSAPEREH		LASLIRLTPT		QVKIWFQNHR		YKMKRARAEK		GMEVTPLPSP
RRVAVPVLVR		DGKPCHALKA		QDLAAATFQA		GIPFSAYSAQ		SLQHMQYNAQ
YSSASTPQYP		TAHPLVQAQQ		WTW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20