PHF21A

PHF21A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PUY, 2YQL
Ідентифікатори
Символи	PHF21A, BHC80, BM-006, PHD finger protein 21A, NEDMS, IDDBCS
Зовнішні ІД	OMIM: 608325 MGI: 2384756 HomoloGene: 9597 GeneCards: PHF21A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0031493 histone binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone deacetylase activity Клітинна компонента • histone deacetylase complex • DNA repair complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • зсідання крові • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51317	192285
Ensembl	ENSG00000135365	ENSMUSG00000058318
UniProt	Q96BD5	Q6ZPK0
RefSeq (мРНК)	NM_001101802 NM_016621 NM_001352025 NM_001352026 NM_001352027 NM_001352028 NM_001352029 NM_001352030 NM_001352031 NM_001352032	NM_001109690 NM_001109691 NM_138755 NM_001346704 NM_001362829 NM_001362830 NM_001362831 NM_001362832 NM_001362833
RefSeq (білок)	NP_001095272 NP_057705 NP_001338954 NP_001338955 NP_001338956 NP_001338957 NP_001338958 NP_001338959 NP_001338960 NP_001338961	NP_001103160 NP_001103161 NP_001333633 NP_620094 NP_001349758 NP_001349759 NP_001349760 NP_001349761 NP_001349762
Локус (UCSC)	Хр. 11: 45.93 – 46.12 Mb	Хр. 2: 92.09 – 92.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHF21A (англ. PHD finger protein 21A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 680 амінокислот, а молекулярна маса — 74 854.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELQTLQEAL		KVEIQVHQKL		VAQMKQDPQN		ADLKKQLHEL		QAKITALSEK
QKRVVEQLRK		NLIVKQEQPD		KFQIQPLPQS		ENKLQTAQQQ		PLQQLQQQQQ
YHHHHAQQSA		AASPNLTASQ		KTVTTASMIT		TKTLPLVLKA		ATATMPASVV
GQRPTIAMVT		AINSQKAVLS		TDVQNTPVNL		QTSSKVTGPG		AEAVQIVAKN
TVTLVQATPP		QPIKVPQFIP		PPRLTPRPNF		LPQVRPKPVA		QNNIPIAPAP
PPMLAAPQLI		QRPVMLTKFT		PTTLPTSQNS		IHPVRVVNGQ		TATIAKTFPM
AQLTSIVIAT		PGTRLAGPQT		VQLSKPSLEK		QTVKSHTETD		EKQTESRTIT
PPAAPKPKRE		ENPQKLAFMV		SLGLVTHDHL		EEIQSKRQER		KRRTTANPVY
SGAVFEPERK		KSAVTYLNST		MHPGTRKRGR		PPKYNAVLGF		GALTPTSPQS
SHPDSPENEK		TETTFTFPAP		VQPVSLPSPT		STDGDIHEDF		CSVCRKSGQL
LMCDTCSRVY		HLDCLDPPLK		TIPKGMWICP		RCQDQMLKKE		EAIPWPGTLA
IVHSYIAYKA		AKEEEKQKLL		KWSSDLKQER		EQLEQKVKQL		SNSISKCMEM
KNTILARQKE		MHSSLEKVKQ		LIRLIHGIDL		SKPVDSEATV		GAISNGPDCT
PPANAATSTP		APSPSSQSCT		ANCNQGEETK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 doi:10.1074/jbc.M208992200

Див. також

• Хромосома 11