Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MESP2
Ідентифікатори
Символи
MESP2 , SCDO2, bHLHc6, mesoderm posterior bHLH transcription factor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 605195 MGI: 1096325 HomoloGene: 7420 GeneCards: MESP2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • mesoderm formation • somitogenesis • heart morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • embryonic pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 89.76 – 89.78 Mb
Хр. 7: 79.46 – 79.46 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MESP2 (англ. Mesoderm posterior bHLH transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот , а молекулярна маса — 41 760[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAQSPPPQSL LGHDHWIFAQ GWGWAGHWDS TSPASSSDSS GSCPCDGARG
LPQPQPPSCS SRAAEAAATT PRRARTGPAG GQRQSASERE KLRMRTLARA
LHELRRFLPP SLAPAGQSLT KIETLRLAIR YIGHLSAVLG LSEESLQCRR
RQRGDAGSPW GCPLCPDRGP AEAQTQAEGQ GQGQGQGQGQ GQGQGQGQGQ
GQGQGRRPGL VSAVLAEASW GSPSACPGAQ AAPERLGRGV HDTDPWATPP
YCPKIQSPPY SSQGTTSDAS LWTPPQGCPW TQSSPEPRNP PVPWTAAPAT
LELAAVYQGL SVSPEPCLSL GAPSLLPHPS CQRLQPQTPG RCWSHSAEVV
PNSEDQGPGA AFQLSEASPP QSSGLRFSGC PELWQEDLEG ARLGIFY
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
McLellan A.S., Langlands K., Kealey T. (2002). Exhaustive identification of human class II basic helix-loop-helix proteins by virtual library screening. Mech. Dev . 119 : S285—S291. PMID 14516699 DOI :10.1016/S0925-4773(03)00130-8
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші