Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RFX2
Ідентифікатори
Символи
RFX2 , regulatory factor X2
Зовнішні ІД
OMIM : 142765 MGI: 106583 HomoloGene: 30980 GeneCards: RFX2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • Сперматогенез • acrosome assembly • spermatid development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell projection organization • cilium assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to leukemia inhibitory factor
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 5.99 – 6.2 Mb
Хр. 17: 57.08 – 57.14 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
RFX2 (англ. Regulatory factor X2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот , а молекулярна маса — 79 987[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQNSEGGADS PASVALRPSA AAPPVPASPQ RVLVQAASSN PKGAQMQPIS
LPRVQQVPQQ VQPVQHVYPA QVQYVEGGDA VYTNGAIRTA YTYNPEPQMY
APSSTASYFE APGGAQVTVA ASSPPAVPSH SMVGITMDVG GSPIVSSAGA
YLIHGGMDST RHSLAHTSRS SPATLEMAIE NLQKSEGITS HKSGLLNSHL
QWLLDNYETA EGVSLPRSSL YNHYLRHCQE HKLDPVNAAS FGKLIRSVFM
GLRTRRLGTR GNSKYHYYGI RLKPDSPLNR LQEDTQYMAM RQQPMHQKPR
YRPAQKTDSL GDSGSHSGLH STPEQTMAVQ SQHHQQYIDV SHVFPEFPAP
DLGSFLLQDG VTLHDVKALQ LVYRRHCEAT VDVVMNLQFH YIEKLWLSFW
NSKASSSDGP TSLPASDEDP EGAVLPKDKL ISLCQCDPIL RWMRSCDHIL
YQALVEILIP DVLRPVPSTL TQAIRNFAKS LEGWLTNAMS DFPQQVIQTK
VGVVSAFAQT LRRYTSLNHL AQAARAVLQN TSQINQMLSD LNRVDFANVQ
EQASWVCQCE ESVVQRLEQD FKLTLQQQSS LDQWASWLDS VVTQVLKQHA
GSPSFPKAAR QFLLKWSFYS SMVIRDLTLR SAASFGSFHL IRLLYDEYMF
YLVEHRVAEA TGETPIAVMG EFNDLASLSL TLLDKDDMGD EQRGSEAGPD
ARSLGEPLVK RERSDPNHSL QGI
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біогенез та деградація війок, диференціація клітин , сперматогенез , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші