HIVEP3

HIVEP3
Ідентифікатори
Символи	HIVEP3, Hivep3, 2900056N03Rik, A130075N07, AI848000, E030045D18Rik, KBP-1, KBP1, Rc, Schnurri-3, Shn3, Zas3, ZNF40C, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, Kappa Recognition Component (Krc), KRC, HIVEP zinc finger 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606649 MGI: 106589 HomoloGene: 7803 GeneCards: HIVEP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • skeletal muscle cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59269	16656
Ensembl	ENSG00000127124	ENSMUSG00000028634
UniProt	Q5T1R4	A2A884
RefSeq (мРНК)	NM_001127714 NM_024503	NM_010657
RefSeq (білок)	NP_001121186 NP_078779	NP_034787
Локус (UCSC)	Хр. 1: 41.51 – 42.04 Mb	Хр. 4: 119.59 – 120 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIVEP3 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 406 амінокислот, а молекулярна маса — 259 465.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPEQSVKGT		KKAEGSPRKR		LTKGEAIQTS		VSSSVPYPGS		GTAATQESPA
QELLAPQPFP		GPSSVLREGS		QEKTGQQQKP		PKRPPIEASV		HISQLPQHPL
TPAFMSPGKP		EHLLEGSTWQ		LVDPMRPGPS		GSFVAPGLHP		QSQLLPSHAS
IIPPEDLPGV		PKVFVPRPSQ		VSLKPTEEAH		KKERKPQKPG		KYICQYCSRP
CAKPSVLQKH		IRSHTGERPY		PCGPCGFSFK		TKSNLYKHRK		SHAHRIKAGL
ASGMGGEMYP		HGLEMERIPG		EEFEEPTEGE		STDSEEETSA		TSGHPAELSP
RPKQPLLSSG		LYSSGSHSSS		HERCSLSQSS		TAQSLEDPPP		FVEPSSEHPL
SHKPEDTHTI		KQKLALRLSE		RKKVIDEQAF		LSPGSKGSTE		SGYFSRSESA
EQQVSPPNTN		AKSYAEIIFG		KCGRIGQRTA		MLTATSTQPL		LPLSTEDKPS
LVPLSVPRTQ		VIEHITKLIT		INEAVVDTSE		IDSVKPRRSS		LSRRSSMESP
KSSLYREPLS		SHSEKTKPEQ		SLLSLQHPPS		TAPPVPLLRS		HSMPSAACTI
STPHHPFRGS		YSFDDHITDS		EALSHSSHVF		TSHPRMLKRQ		PAIELPLGGE
YSSEEPGPSS		KDTASKPSDE		VEPKESELTK		KTKKGLKTKG		VIYECNICGA
RYKKRDNYEA		HKKYYCSELQ		IAKPISAGTH		TSPEAEKSQI		EHEPWSQMMH
YKLGTTLELT		PLRKRRKEKS		LGDEEEPPAF		ESTKSQFGSP		GPSDAARNLP
LESTKSPAEP		SKSVPSLEGP		TGFQPRTPKP		GSGSESGKER		RTTSKEISVI
QHTSSFEKSD		SLEQPSGLEG		EDKPLAQFPS		PPPAPHGRSA		HSLQPKLVRQ
PNIQVPEILV		TEEPDRPDTE		PEPPPKEPEK		TEEFQWPQRS		QTLAQLPAEK
LPPKKKRLRL		AEMAQSSGES		SFESSVPLSR		SPSQESNVSL		SGSSRSASFE
RDDHGKAEAP		SPSSDMRPKP		LGTHMLTVPS		HHPHAREMRR		SASEQSPNVS
HSAHMTETRS		KSFDYGSLSL		TGPSAPAPVA		PPARVAPPER		RKCFLVRQAS
LSRPPESELE		VAPKGRQESE		EPQPSSSKPS		AKSSLSQISS		AATSHGGPPG
GKGPGQDRPP		LGPTVPYTEA		LQVFHHPVAQ		TPLHEKPYLP		PPVSLFSFQH
LVQHEPGQSP		EFFSTQAMSS		LLSSPYSMPP		LPPSLFQAPP		LPLQPTVLHP
GQLHLPQLMP		HPANIPFRQP		PSFLPMPYPT		SSALSSGFFL		PLQSQFALQL
PGDVESHLPQ		IKTSLAPLAT		GSAGLSPSTE		YSSDIRLPPV		APPASSSAPT
SAPPLALPAC		PDTMVSLVVP		VRVQTNMPSY		GSAMYTTLSQ		ILVTQSQGSS
ATVALPKFEE		PPSKGTTVCG		ADVHEVGPGP		SGLSEEQSRA		FPTPYLRVPV
TLPERKGTSL		SSESILSLEG		SSSTAGGSKR		VLSPAGSLEL		TMETQQQKRV
KEEEASKADE		KLELVKPCSV		VLTSTEDGKR		PEKSHLGNQG		QGRRELEMLS
SLSSDPSDTK		EIPPLPHPAL		SHGTAPGSEA		LKEYPQPSGK		PHRRGLTPLS
VKKEDSKEQP		DLPSLAPPSS		LPLSETSSRP		AKSQEGTDSK		KVLQFPSLHT
TTNVSWCYLN		YIKPNHIQHA		DRRSSVYAGW		CISLYNPNLP		GVSTKAALSL
LRSKQKVSKE		TYTMATAPHP		EAGRLVPSSS		RKPRMTEVHL		PSLVSPEGQK
DLARVEKEEE		RRGEPEEDAP		ASQRGEPARI		KIFEGGYKSN		EEYVYVRGRG
RGKYVCEECG		IRCKKPSMLK		KHIRTHTDVR		PYVCKHCHFA		FKTKGNLTKH
MKSKAHSKKC		QETGVLEELE		AEEGTSDDLF		QDSEGREGSE		AVEEHQFSDL
EDSDSDSDLD		EDEDEDEEES		QDELSRPSSE		APPPGPPHAL		RADSSPILGP
QPPDAPASGT		EATRGSSVSE		AERLTASSCS		MSSQSMPGLP		WLGPAPLGSV
EKDTGSALSY		KPVSPRRPWS		PSKEAGSRPP		LARKHSLTKN		DSSPQRCSPA
REPQASAPSP		PGLHVDPGRG		MGALPCGSPR		LQLSPLTLCP		LGRELAPRAH
VLSKLEGTTD		PGLPRYSPTR		RWSPGQAESP		PRSAPPGKWA		LAGPGSPSAG
EHGPGLGLDP		RVLFPPAPLP		HKLLSRSPET		CASPWQKAES		RSPSCSPGPA
HPLSSRPFSA		LHDFHGHILA		RTEENIFSHL		PLHSQHLTRA		PCPLIPIGGI
QMVQARPGAH		PTLLPGPTAA		WVSGFSGGGS		DLTGAREAQE		RGRWSPTESS
SASVSPVAKV		SKFTLSSELE		GGDYPKERER		TGGGPGRPPD		WTPHGTGAPA
EPTPTHSPCT		PPDTLPRPPQ		GRRAAQSWSP		RLESPRAPTN		PEPSATPPLD
RSSSVGCLAE		ASARFPARTR		NLSGEPRTRQ		DSPKPSGSGE		PRAHPHQPED
RVPPNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Hicar M.D., Liu Y., Allen C.E., Wu L.-C. (2001). Structure of the human zinc finger protein HIVEP3: molecular cloning, expression, exon-intron structure, and comparison with paralogous genes HIVEP1 and HIVEP2. Genomics. 71: 89—100. PMID 11161801 DOI:10.1006/geno.2000.6425
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1