Рецептор вітаміну D

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
VDR
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи VDR, NR1I1, PPP1R163, vitamin D (1,25- dihydroxyvitamin D3) receptor, vitamin D receptor
Зовнішні ІД OMIM: 601769 MGI: 103076 HomoloGene: 37297 GeneCards: VDR
Пов'язані генетичні захворювання
vitamin D-dependent rickets, type 2[1]
Реагує на сполуку
кальцитріол, calcipotriene, doxercalciferol, lithocholic acid, paricalcitol, tacalcitol[2]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_009504
RefSeq (білок)
NP_033530
Локус (UCSC) Хр. 12: 47.84 – 47.94 Mb Хр. 15: 97.75 – 97.81 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VDR (англ. Vitamin D receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 48 289[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRR
SMKRKALFTCPFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEV
QRKREMILKRKEEEALKDSLRPKLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDF
CQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFSGDSSSSCSDHCITSSDMMDSS
SFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQKVIGFAKMIPG
FRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSDV
TKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAA
LIEAIQDRLSNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQ
YRCLSFQPECSMKLTPLVLEVFGNEIS

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Goto H., Chen K.S., Prahl J.M., Deluca H.F. (1992). A single receptor identical with that from intestine/T47D cells mediates the action of 1,25-dihydroxyvitamin D-3 in HL-60 cells. Biochim. Biophys. Acta. 1132: 103—108. PMID 1324736 DOI:10.1016/0167-4781(92)90063-6
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Mahajan M.A., Samuels H.H. (2000). A new family of nuclear receptor coregulators that integrates nuclear receptor signaling through CBP. Mol. Cell. Biol. 20: 5048—5063. PMID 10866662 DOI:10.1128/MCB.20.14.5048-5063.2000
  • Rochel N., Wurtz J.-M., Mitschler A., Klaholz B., Moras D. (2000). The crystal structure of the nuclear receptor for vitamin D bound to its natural ligand. Mol. Cell. 5: 173—179. PMID 10678179 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80413-X
  • Tocchini-Valentini G., Rochel N., Wurtz J.-M., Mitschler A., Moras D. (2001). Crystal structures of the vitamin D receptor complexed to superagonist 20-epi ligands. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 5491—5496. PMID 11344298 DOI:10.1073/pnas.091018698
  • Shaffer P.L., Gewirth D.T. (2002). Structural basis of VDR-DNA interactions on direct repeat response elements. EMBO J. 21: 2242—2252. PMID 11980721 DOI:10.1093/emboj/21.9.2242

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]